本研究では、赤潮、貧酸素水塊の発生を抑制し、三河湾に健全な生態系を回復するための、科学的な根拠に基づく具体的な手法を提案することを最終目的とする。特に、降雨時の栄養塩流入とその湾内の応答に焦点を絞り、大気を含む流域からの負荷機構、流入栄養塩が赤潮、貧酸素水塊発生へと移行する仕組み、アマモ場、干潟域の水質浄化機能の３点について、栄養塩の循環動態を基にして解明する。本調査結果を基に、栄養塩流入負荷や湾内流入後の栄養塩の動態から、赤潮、貧酸素水塊の発生がシミュレート可能なモデル開発を行う。このモデルを用いて、実現可能で三河湾の環境改善に有効な、負荷削減策とアマモ場、干潟域造成策を提案する。