生態系の構造と機能は、長い進化過程で培われた、種の多様性と遺伝的多様性からなる生物多様性に依存する。生物多様性の低下は、生物間相互作用ネットワークの構成要素の脱落を招き、様々な生態系サービスや回復力の喪失につながる。地球温暖化の進行、そしてその影響への対処として、こうしたメカニズム等を明らかにしつつ、水圏の豊かな生物生産を保証する、多様性に富む水圏生態系の保全を図っていくことは重要な課題である。本研究は、既に地球温暖化による影響が及んでいるサケ属魚類を対象とし、キーストーン種（※）としての亜寒帯水圏生態系の順応的管理と、予防原則に基づく生態系ベースのサステナビリティとリスクマネージメントの確立を目指すもの。具体的には、以下を行う。
①サケの生活史戦略、および野生魚と孵化場魚の生物学的相互作用の調査
②温暖化がサケに及ぼす影響評価、亜寒帯海域の水圏生態系把握、ヒューマン・インパクトによる水圏生態系の不確実性評価モデルの検討なお、以下の大学に所属する研究員と共同研究を行なう。ワシントン大学、アラスカ大学フェアバンクス校・ジュノー校、アラスカ州水産狩猟局。
※生態系の生物間相互作用の中で、要かなめいなくなれば、その生態系の特色が大きく変わるもの。の役割を果たし、その種がいなくなれば、その生態系の特色が大きく変わるもの。